■ Èifeachdas leudachaidh àrd: faodar mìrean DNA de dhiofar mheudan (nas ìsle na 5 kb) agus stòran a mheudachadh gu h-èifeachdach.
■ Cugallachd àrd: Faodar cho ìosal ri 10 cg de mhìrean targaid a mheudachadh bho theamplaidean genomic.
■ Frith-aghaidh cuideam àrd: Airson teamplaidean le susbaint àrd impurity leithid teamplaid garbh-tharraing / cultar bacterial, faodar an criomag targaid a mheudachadh gu furasta. Cha toir reothadh is leaghadh a-rithist buaidh air gnìomhachd polymerase.
■ Goireasach airson tagraidhean: Chaidh an siostam ath-bhualadh ullachadh gu furasta agus gu sgiobalta. Anns a ’chriomag leudaichte tha an dA-overhang 3 ′, a tha goireasach airson clonadh TA.
Seòrsa: Taq DNA polymerase
Eisimpleir: Teamplaid purraichte / garbh-tharraingeach / cultar bacterial
Teamplaid: > 10 cg
Meud criomag: <5 kb
Tagraidhean: Meudachadh PCR air criomagan DNA, bileagan DNA, leudachadh primer, dearbhadh òrdugh, lorg gine air sgèile mhòr, deuchainnean PCR leth-chainnteach, lorg lorg DNA, msaa.
Faodar na toraidhean gu lèir a ghnàthachadh airson ODM / OEM. Airson mion-fhiosrachadh,cliog air Seirbheis Customized (ODM / OEM)
Figear 1. Chaidh teamplaidean bho stòran eadar-dhealaichte a mheudachadh le TIANGEN Taq MasterMix II agus an Taq Mix cumanta bho Supplier TR fa leth gus strì an aghaidh ath-bheachdan a lorg. Tha na co-dhùnaidhean a ’sealltainn gum faod toraidhean TIANGEN leudachadh a dhèanamh air na criomagan targaid bho theamplaidean genomic amh agus cultar bacterial, agus tha an strì an cuideam nas fheàrr na tha e bho Supplier TR. A: Teamplaid genomic amh air a thoirt a-mach le TIANGEN TIANcombi DNA Lyse & Det PCR Kit. Prp / DN: Toirt air falbh agus lorg sampallan fala daonna. Rice: Toirt air falbh amh agus lorg sampallan rus. B: PCR coloinidh. Is e criomag PCR 700 bp. M: Comharra TIANGEN III |
|
Uile-choitcheannachd math airson teamplaidean bho dhiofar stòran agus le diofar fhaid Figear 2. Chaidh mìrean de dhiofar stòran agus faid a mheudachadh le bhith a ’cleachdadh TIANGEN Taq MasterMix II (A) agus àbhaisteach Taq Measgachadh Solaraiche TK (B), Solaraiche TR (C), Solaraiche V (D) agus Solaraiche G (E) fa leth. Tha na toraidhean a ’sealltainn gur e an coileanadh coileanta de thoraidhean TIANGEN as fheàrr a thaobh comas leudachaidh, sònrachas agus uile-choitcheann.M: TIANGEN Marker III1: Teamplaid genomic DNA soybean (120 bp); 2-3: Teamplaid DNA genomic Rice (694 bp, 2258 bp); 4: Teamplaid DNA genomic cotan (200 bp); 5: Escherichia coli teamplaid DNA genomic (2298 bp); 6-7: Teamplaid DNA genome luchag (1 kb, 2 kb); 8-10: Teamplaid DNA genomic Rat (1 kb, 2 kb, 2080 bp); 11-18: Teamplaid DNA genome daonna (300 bp, 448 bp (GC%: 74.8%), 1100 bp, 750 bp, 1000 bp, 1090 bp (GC%: 70.4%), 2 kb, 4 kb) |
|
Àrd cugallachd Figear 3. Chaidh diofar cho-chruinneachaidhean de mhìrean radan agus DNA daonna a mheudachadh le bhith a ’cleachdadh TIANGEN Taq MasterMix II (A), àbhaisteach Taq Measgachadh de sholaraiche V (B) agus solaraiche TK (C), fa leth, gus cugallachd an leudachaidh a lorg. Tha na toraidhean a ’sealltainn gum faodadh toradh TIANGEN leudachadh a dhèanamh air a’ chriomag targaid bhon teamplaid genome cho ìosal ri 0.01 ng, agus tha a chugallachd nas fheàrr na toraidhean bho sholaraiche V agus TK.M: TIANGEN Marker III, N: NTCTemplate input 1-8 : 200 ng, 100 ng, 50 ng, 20 ng, 10 ng, 1 ng, 0.1 ng, 0.01 ng. |
Teamplaid A-1
■ Anns an teamplaid tha neo-chunbhalachd pròtain no luchd-dìon Taq, msaa. ——Purify teamplaid DNA, cuir às do phròtainean pròtain no thoir air falbh teamplaid DNA le innealan glanaidh.
■ Chan eil dì-ghalarachadh an teamplaid coileanta —— Gu h-iomchaidh ag àrdachadh teòthachd dì-ghalarachadh agus a ’leudachadh ùine dì-ghalarachaidh.
■ Milleadh teamplaid —— Ath-ullaich an teamplaid.
Primer A-2
■ Droch càileachd primers —— Dèan ath-synthesachadh an primer.
. Seachain ioma-reothadh agus leaghadh no cryopreserved 4 ° C fad-ùine.
■ Dealbhadh neo-sheasmhach de phrìomhairean (me chan eil fad primer gu leòr, dimer air a chruthachadh eadar primers, msaa.) - Ath-dhealbhadh primers (seachain cruthachadh primer dimer agus structar àrd-sgoile)
A-3 Mg2+dùmhlachd
■ Mg2+ dùmhlachd ro ìosal —— Meudaich Mg gu iomchaidh2+ dùmhlachd: Optimize an Mg2+ dùmhlachd le sreath de ath-bheachdan bho 1 mM gu 3 mM le eadar-ama de 0.5 mM gus an Mg as fheàrr a dhearbhadh2+ dùmhlachd airson gach teamplaid agus primer.
A-4 Teòthachd Annealing
■ Bidh an teòthachd àrd annealing a ’toirt buaidh air ceangal primer agus teamplaid. —— Thoir air falbh an teòthachd blàthachaidh agus dèan an staid as fheàrr le caisead 2 ° C.
Ùine leudachaidh A-5
■ Ùine leudachaidh goirid —— Meudaich an ùine leudachaidh.
Phenomena: Bidh sampaill àicheil cuideachd a ’sealltainn na bannan òrdugh targaid.
Truailleadh A-1 de PCR
■ Tar-thruailleadh sreath targaid no toraidhean leudachaidh —— Gu faiceallach gun a bhith a ’pìobadh an sampall anns a bheil sreath targaid anns an sampall àicheil no gan dòrtadh a-mach às an tiùb centrifuge. Bu chòir na h-ath-bheachdan no an uidheamachd a bhith fèin-ghluasadach gus cuir às do dh ’aigéid niuclasach a th’ ann, agus bu chòir truailleadh a bhith ann tro dheuchainnean smachd àicheil.
■ Truailleadh ath-bheachdan ——Cuir na h-ath-bheachdan agus stòr aig teòthachd ìosal.
A-2 Primer
■ Mg2+ dùmhlachd ro ìosal —— Meudaich Mg gu iomchaidh2+ dùmhlachd: Optimize an Mg2+ dùmhlachd le sreath de ath-bheachdan bho 1 mM gu 3 mM le eadar-ama de 0.5 mM gus an Mg as fheàrr a dhearbhadh2+ dùmhlachd airson gach teamplaid agus primer.
■ Dealbhadh primer neo-iomchaidh, agus tha homology aig an t-sreath targaid leis an t-sreath neo-targaid. —— Ath-dhealbhadh primers.
Phenomena: Tha na bannan leudachaidh PCR neo-chunbhalach leis a ’mheud ris a bheil dùil, an dara cuid mòr no beag, no uaireannan bidh an dà chuid bannan leudachaidh sònraichte agus bannan leudachaidh neo-shònraichte a’ tachairt.
Primer A-1
■ Sònrachas primer bochd
—— Ath-dhealbhadh primer.
■ Tha an dùmhlachd primer ro àrd —— Meudaich teothachd an dì-ghalarachadh agus cuir ris an ùine dì-ghalarachadh.
A-2 Mg2+ dùmhlachd
■ Am Mg2+ tha an dùmhlachd ro àrd —— Lùghdaich gu ceart an dùmhlachd Mg2 +: Optimize an Mg2+ dùmhlachd le sreath de ath-bheachdan bho 1 mM gu 3 mM le eadar-ama de 0.5 mM gus an Mg as fheàrr a dhearbhadh2+ dùmhlachd airson gach teamplaid agus primer.
A-3 Polymerase thermostable
■ Meud cus enzyme —— Thoir air falbh suim enzyme gu h-iomchaidh aig amannan 0.5 U.
A-4 Teòthachd Annealing
■ Tha an teòthachd annealing ro ìosal —— Gu h-iomchaidh àrdaich an teòthachd blàthachaidh no gabh ris an dòigh annealing dà ìre
Cearcaill A-5 PCR
■ Cus de chearcaill PCR —— Lùghdaich an àireamh de chearcaill PCR.
Primer A-1—— Sònrachas sònraichte —— Ath-dhealbhaich an primer, atharraich suidheachadh agus fad a ’phrìomhaire gus a shònrachas a neartachadh; no a ’dèanamh PCR neadaichte.
Teamplaid A-2 DNA
—— Chan eil an teamplaid fìor-ghlan ——Purify an teamplaid no tarraing DNA le pasgain glanaidh.
A-3 Mg2+ dùmhlachd
——Mg2+ dùmhlachd ro àrd —— Lùghdaich Mg gu ceart2+ dùmhlachd: Optimize an Mg2+ dùmhlachd le sreath de ath-bheachdan bho 1 mM gu 3 mM le eadar-ama de 0.5 mM gus an Mg as fheàrr a dhearbhadh2+ dùmhlachd airson gach teamplaid agus primer.
A-4 dNTP
——Tha dùmhlachd dNTPs ro àrd —— Thoir air falbh dùmhlachd dNTP gu h-iomchaidh
A-5 Teòthachd Annealing
——Tha teòthachd blàthachaidh ìosal —— Gu h-iomchaidh àrdaich an teòthachd blàthachaidh
Cearcaill A-6
——To iomadh cearcall —— Dèan lùghdachadh air an àireamh rothaireachd
Is e a ’chiad cheum am polymerase iomchaidh a thaghadh. Chan urrainnear Taq polymerase cunbhalach a dhearbhadh air sgàth dìth gnìomhachd ro-sgaoileadh 3’-5 ’, agus bidh mì-chothromachadh a’ lughdachadh èifeachdas leudachaidh criomagan gu mòr. Mar sin, chan urrainn dha Taq polymerase cunbhalach leudachadh a dhèanamh air mìrean targaid nas motha na 5 kb. Bu chòir Taq polymerase le atharrachadh sònraichte no polymerase fidelity àrd eile a thaghadh gus èifeachdas leudachaidh a leasachadh agus coinneachadh ri feumalachdan leudachadh criomag fada. A bharrachd air an sin, tha leudachadh air criomagan fada cuideachd ag iarraidh atharrachadh co-fhreagarrach air dealbhadh primer, ùine denaturation, ùine leudachaidh, pH bufair, msaa. Mar as trice, faodaidh primers le 18-24 bp toradh nas fheàrr a thoirt seachad. Gus casg a chuir air milleadh teamplaid, bu chòir an ùine dì-ghalarachaidh aig 94 ° C a lùghdachadh gu 30 diog no nas lugha gach cearcall, agus bu chòir an ùine airson teòthachd àrdachadh gu 94 ° C mus tèid an leudachadh a dhèanamh nas lugha na 1 min. A bharrachd air an sin, le bhith a ’suidheachadh teothachd an leudachaidh aig timcheall air 68 ° C agus a’ dealbhadh na h-ùine leudachaidh a rèir ìre 1 kb / min faodaidh sin dèanamh cinnteach gu bheil leudachadh èifeachdach air criomagan fada.
Faodar an ìre mearachd de leudachadh PCR a lùghdachadh le bhith a ’cleachdadh diofar polymerases DNA le fìor dhìlseachd. Am measg a h-uile polymeras DNA Taq a chaidh a lorg gu ruige seo, tha an ìre mearachd as ìsle agus an dìlseachd as àirde aig Pfu enzyme (faic an clàr ceangailte). A bharrachd air taghadh enzyman, faodaidh luchd-rannsachaidh ìre mùthaidh PCR a lughdachadh tuilleadh le bhith a ’dèanamh an fheum as fheàrr de shuidheachaidhean ath-bhualadh, a’ gabhail a-steach dèanamh suas bufair, dùmhlachd de polymerase thermostable agus a ’dèanamh an fheum as fheàrr de chearcall PCR.
Bho chaidh a stèidheachadh, tha an fhactaraidh againn air a bhith a ’leasachadh toraidhean den chiad ìre le bhith a’ cumail ris a ’phrionnsapal
de chàileachd an toiseach. Tha na toraidhean againn air cliù air leth fhaighinn anns a ’ghnìomhachas agus luachmhor am measg luchd-ceannach ùr is sean.