Tha 1 aonad (U) gnìomhachd Taq Platinum DNA Polymerase air a mhìneachadh mar an ìre de enzym a dh ’fheumar gus 10 de nmynucleotides 10 nmol a thoirt a-steach do stuthan searbhagach aig 74 ° C taobh a-staigh 30 min a’ cleachdadh DNA sperm bradan gnìomhaichte mar theamplaid / primer.
Tha an purrachd le lorg SDS-PAGE nas motha na 99%; Chan eilear a ’lorg gnìomhachd de nuclease exogenous; Dh ’fhaodadh gine aon-bhreac ann an genoma daonna a bhith air a mheudachadh gu h-èifeachdach; Cha bhith atharrachadh mòr sam bith ann an gnìomhachd nuair a thèid a stòradh aig teòthachd an t-seòmair airson seachdain.
Tha gnìomhachd exonuclease 5’-3 ′ aige agus gnìomhachd exonuclease 3’-5 ′, agus tha a dhìlseachd ri taobh Pfu polymerase. Tha astar leudachaidh Taq Platinum Polymerase nas luaithe na Pfu polymerase agus tha an èifeachdas leudachaidh nas àirde. Faodar toraidhean PCR a cheangal gu dìreach ris a ’cheann mhaol no an glaodh le vectar TA. Ma dh ’fheumas èifeachdas clonaidh a leasachadh, thathas a’ moladh glanadh an toiseach agus cuir thairis 3’-dA overhangs mus clònadh a-steach do vectar TA.
MasterMix Platinum Taq aon-tiùb (Teisteanas Bathar Àrd-tech Nàiseanta)
■ Tha an Taq Platinum MasterMix air sònrachas agus cugallachd freagairt PCR a leasachadh agus faodaidh e teamplaidean iom-fhillte a mheudachadh le susbaint àrd GC, structar àrd-sgoile agus an leithid. Faodar cho beag ri 2 leth-bhreac den teamplaid targaid a mheudachadh, a ’dèanamh cinnteach à toraidhean deuchainneach nas cruinne.
■ Tha am foirmle sònraichte Taq Platinum MasterMix a ’dèanamh an siostam ath-bhualadh gu lèir gu math seasmhach, agus cha toir an reothadh-thaw no stòradh fad-ùine buaidh air 4 ° C.
■ Faodaidh am fuasgladh measgaichte PCR seasmhach agus èifeachdach ro-ullaichte an obair a dhèanamh luath agus sìmplidh, a ’lughdachadh gu mòr dian saothair agus mearachd samplachaidh. Tha leasaiche PCR àrd-choileanadh agus optimizer cuideachd air an toirt a-steach don mheasgachadh, a tha a ’lughdachadh na riatanasan a thaobh cumhaichean PCR.
■ Tha an dà chuid siostaman anns a bheil dath agus siostaman gun dath. Faodar toraidhean MasterMix anns a bheil dath a bhith air an electrophoresed gu dìreach às deidh PCR, gun a bhith a ’cur bufair luchdachaidh ris.
Faodaidh e àite a thoirt do Pfu polymerase gus toraidhean àrd-dhìlseachd àrdachadh bho theamplaidean iom-fhillte leithid genomes, agus tha e freagarrach airson tagraidhean leithid clonadh de ghinean abairt, mùthaidhean sònraichte don làrach agus mion-sgrùdadh air polymorphism nucleotide singilte (SNP), msaa.
Earalas ann a bhith a ’dealbhadh primers PCR:
Mar as trice is e 20-25 mer an fhaid primer. Ach, nuair a bhios tu a ’coileanadh PCR criomag fada, bu chòir an fhaid primer a mheudachadh gu 30-35 mer.
■ Chan eil càradh co-phàirteach eadar an dà phrìomhaire, gu sònraichte airson na 3 buinn mu dheireadh aig a ’cheann 3 ′.
■ Bu chòir susbaint GC a bhith 50-60%, agus seachain GC no AT beairteach ionadail. Gus am bi primer agus teamplaid a ’ceangal gu seasmhach, seachain structar beairteach AT aig a’ cheann 3 ′.
■ Seachain primer gus structar àrd-sgoile a chruthachadh.
■ Tagh dà phrìomhaire le teodhachd Tm faisg air a chèile.
Obrachadh a-mach luach Tm de phrìomhairean airson PCR:
■ Nuair a tha an primer nas lugha na 20 mer: Tm = 2 ° C × (A + T) + 4 ° C × (G + C).
■ Nuair a tha an primer nas motha na 20 mer: Tm = 81.5 + 0.41 × (GC%) - 600 / L, far a bheil L fad na primer.
■ Suidhich an teòthachd annealing aig (Tm-5) ° C.
Faodar an dùmhlachd deireannach iomchaidh de primers a thaghadh eadar 0.1 μM agus 1.0 μM. Bidh dùmhlachd primer ro ìosal a ’leantainn gu toradh ìosal de thoraidhean leudachaidh, fhad‘ s a tha dùmhlachd ro àrd nas dualtaiche do leudachadh neo-shònraichte. Mar as trice, nuair a tha an tomhas de DNA teamplaid mòr no iom-fhillte DNA teamplaid (leithid DNA genome daonna) air a chleachdadh mar theamplaid, bu chòir an dùmhlachd primer a bhith nas ìsle. Nuair a tha an tomhas de DNA teamplaid beag no sìmplidh teamplaid DNA (me, plasmid DNA, msaa) air a chleachdadh mar theamplaid, bu chòir an dùmhlachd primer a bhith nas àirde.
Faodar na toraidhean gu lèir a ghnàthachadh airson ODM / OEM. Airson mion-fhiosrachadh,cliog air Seirbheis Customized (ODM / OEM)
Cleachd DNA genomic mar theamplaid gus criomag 1 kb a mheudachadh. Às deidh an ath-bhualadh PCR, gabh 5 μl airson lorg electrophoresis. |
Teamplaid A-1
■ Anns an teamplaid tha neo-chunbhalachd pròtain no luchd-dìon Taq, msaa. ——Purify teamplaid DNA, cuir às do phròtainean pròtain no thoir air falbh teamplaid DNA le innealan glanaidh.
■ Chan eil dì-ghalarachadh an teamplaid coileanta —— Gu h-iomchaidh ag àrdachadh teòthachd dì-ghalarachadh agus a ’leudachadh ùine dì-ghalarachaidh.
■ Milleadh teamplaid —— Ath-ullaich an teamplaid.
Primer A-2
■ Droch càileachd primers —— Dèan ath-synthesachadh an primer.
. Seachain ioma-reothadh agus leaghadh no cryopreserved 4 ° C fad-ùine.
■ Dealbhadh neo-sheasmhach de phrìomhairean (me chan eil fad primer gu leòr, dimer air a chruthachadh eadar primers, msaa.) - Ath-dhealbhadh primers (seachain cruthachadh primer dimer agus structar àrd-sgoile)
A-3 Mg2+dùmhlachd
■ Mg2+ dùmhlachd ro ìosal —— Meudaich Mg gu iomchaidh2+ dùmhlachd: Optimize an Mg2+ dùmhlachd le sreath de ath-bheachdan bho 1 mM gu 3 mM le eadar-ama de 0.5 mM gus an Mg as fheàrr a dhearbhadh2+ dùmhlachd airson gach teamplaid agus primer.
A-4 Teòthachd Annealing
■ Bidh an teòthachd àrd annealing a ’toirt buaidh air ceangal primer agus teamplaid. —— Thoir air falbh an teòthachd blàthachaidh agus dèan an staid as fheàrr le caisead 2 ° C.
Ùine leudachaidh A-5
■ Ùine leudachaidh goirid —— Meudaich an ùine leudachaidh.
Phenomena: Bidh sampaill àicheil cuideachd a ’sealltainn na bannan òrdugh targaid.
Truailleadh A-1 de PCR
■ Tar-thruailleadh sreath targaid no toraidhean leudachaidh —— Gu faiceallach gun a bhith a ’pìobadh an sampall anns a bheil sreath targaid anns an sampall àicheil no gan dòrtadh a-mach às an tiùb centrifuge. Bu chòir na h-ath-bheachdan no an uidheamachd a bhith fèin-ghluasadach gus cuir às do dh ’aigéid niuclasach a th’ ann, agus bu chòir truailleadh a bhith ann tro dheuchainnean smachd àicheil.
■ Truailleadh ath-bheachdan ——Cuir na h-ath-bheachdan agus stòr aig teòthachd ìosal.
A-2 Primer
■ Mg2+ dùmhlachd ro ìosal —— Meudaich Mg gu iomchaidh2+ dùmhlachd: Optimize an Mg2+ dùmhlachd le sreath de ath-bheachdan bho 1 mM gu 3 mM le eadar-ama de 0.5 mM gus an Mg as fheàrr a dhearbhadh2+ dùmhlachd airson gach teamplaid agus primer.
■ Dealbhadh primer neo-iomchaidh, agus tha homology aig an t-sreath targaid leis an t-sreath neo-targaid. —— Ath-dhealbhadh primers.
Phenomena: Tha na bannan leudachaidh PCR neo-chunbhalach leis a ’mheud ris a bheil dùil, an dara cuid mòr no beag, no uaireannan bidh an dà chuid bannan leudachaidh sònraichte agus bannan leudachaidh neo-shònraichte a’ tachairt.
Primer A-1
■ Sònrachas primer bochd
—— Ath-dhealbhadh primer.
■ Tha an dùmhlachd primer ro àrd —— Meudaich teothachd an dì-ghalarachadh agus cuir ris an ùine dì-ghalarachadh.
A-2 Mg2+ dùmhlachd
■ Am Mg2+ tha an dùmhlachd ro àrd —— Lùghdaich gu ceart an dùmhlachd Mg2 +: Optimize an Mg2+ dùmhlachd le sreath de ath-bheachdan bho 1 mM gu 3 mM le eadar-ama de 0.5 mM gus an Mg as fheàrr a dhearbhadh2+ dùmhlachd airson gach teamplaid agus primer.
A-3 Polymerase thermostable
■ Meud cus enzyme —— Thoir air falbh suim enzyme gu h-iomchaidh aig amannan 0.5 U.
A-4 Teòthachd Annealing
■ Tha an teòthachd annealing ro ìosal —— Gu h-iomchaidh àrdaich an teòthachd blàthachaidh no gabh ris an dòigh annealing dà ìre
Cearcaill A-5 PCR
■ Cus de chearcaill PCR —— Lùghdaich an àireamh de chearcaill PCR.
Primer A-1—— Sònrachas sònraichte —— Ath-dhealbhaich an primer, atharraich suidheachadh agus fad a ’phrìomhaire gus a shònrachas a neartachadh; no a ’dèanamh PCR neadaichte.
Teamplaid A-2 DNA
—— Chan eil an teamplaid fìor-ghlan ——Purify an teamplaid no tarraing DNA le pasgain glanaidh.
A-3 Mg2+ dùmhlachd
——Mg2+ dùmhlachd ro àrd —— Lùghdaich Mg gu ceart2+ dùmhlachd: Optimize an Mg2+ dùmhlachd le sreath de ath-bheachdan bho 1 mM gu 3 mM le eadar-ama de 0.5 mM gus an Mg as fheàrr a dhearbhadh2+ dùmhlachd airson gach teamplaid agus primer.
A-4 dNTP
——Tha dùmhlachd dNTPs ro àrd —— Thoir air falbh dùmhlachd dNTP gu h-iomchaidh
A-5 Teòthachd Annealing
——Tha teòthachd blàthachaidh ìosal —— Gu h-iomchaidh àrdaich an teòthachd blàthachaidh
Cearcaill A-6
——To iomadh cearcall —— Dèan lùghdachadh air an àireamh rothaireachd
Is e a ’chiad cheum am polymerase iomchaidh a thaghadh. Chan urrainnear Taq polymerase cunbhalach a dhearbhadh air sgàth dìth gnìomhachd ro-sgaoileadh 3’-5 ’, agus bidh mì-chothromachadh a’ lughdachadh èifeachdas leudachaidh criomagan gu mòr. Mar sin, chan urrainn dha Taq polymerase cunbhalach leudachadh a dhèanamh air mìrean targaid nas motha na 5 kb. Bu chòir Taq polymerase le atharrachadh sònraichte no polymerase fidelity àrd eile a thaghadh gus èifeachdas leudachaidh a leasachadh agus coinneachadh ri feumalachdan leudachadh criomag fada. A bharrachd air an sin, tha leudachadh air criomagan fada cuideachd ag iarraidh atharrachadh co-fhreagarrach air dealbhadh primer, ùine denaturation, ùine leudachaidh, pH bufair, msaa. Mar as trice, faodaidh primers le 18-24 bp toradh nas fheàrr a thoirt seachad. Gus casg a chuir air milleadh teamplaid, bu chòir an ùine dì-ghalarachaidh aig 94 ° C a lùghdachadh gu 30 diog no nas lugha gach cearcall, agus bu chòir an ùine airson teòthachd àrdachadh gu 94 ° C mus tèid an leudachadh a dhèanamh nas lugha na 1 min. A bharrachd air an sin, le bhith a ’suidheachadh teothachd an leudachaidh aig timcheall air 68 ° C agus a’ dealbhadh na h-ùine leudachaidh a rèir ìre 1 kb / min faodaidh sin dèanamh cinnteach gu bheil leudachadh èifeachdach air criomagan fada.
Faodar an ìre mearachd de leudachadh PCR a lùghdachadh le bhith a ’cleachdadh diofar polymerases DNA le fìor dhìlseachd. Am measg a h-uile polymeras DNA Taq a chaidh a lorg gu ruige seo, tha an ìre mearachd as ìsle agus an dìlseachd as àirde aig Pfu enzyme (faic an clàr ceangailte). A bharrachd air taghadh enzyman, faodaidh luchd-rannsachaidh ìre mùthaidh PCR a lughdachadh tuilleadh le bhith a ’dèanamh an fheum as fheàrr de shuidheachaidhean ath-bhualadh, a’ gabhail a-steach dèanamh suas bufair, dùmhlachd de polymerase thermostable agus a ’dèanamh an fheum as fheàrr de chearcall PCR.
Bho chaidh a stèidheachadh, tha an fhactaraidh againn air a bhith a ’leasachadh toraidhean den chiad ìre le bhith a’ cumail ris a ’phrionnsapal
de chàileachd an toiseach. Tha na toraidhean againn air cliù air leth fhaighinn anns a ’ghnìomhachas agus luachmhor am measg luchd-ceannach ùr is sean.