■ Gu sìmplidh agus gu sgiobalta: faodar DNA bho dhiofar fhigheachan a thoirt a-mach ann an 5 min gun fheum air bleith nitrogen leaghte.
■ Tagraidhean farsaing: Freagarrach airson duilleagan planntrais, sìol, stuth bheathaichean, sampallan fala (fuil ùr, anti-leigheas, clots fuil, spotan fala tiormaichte, msaa), beirm agus bacteria.
■ Co-chòrdalachd làidir: Tha an ath-fhreagairt PCR freagarrach airson leudachadh air DNA a chaidh a thoirt bho ghrunn stòran sampaill.
■ Dearbhadh gine: Roghainn air leth airson lorg gine mòr-sgèile.
■ Airson samples anns a bheil ìre àrd de phenols, leithid duilleagan cotan, bu chòir an tomhas cuir a-steach sampall a bhith nas ìsle na 0.4 mg, air neo bidh buaidh air ath-bhualadh PCR.
Faodar na toraidhean gu lèir a ghnàthachadh airson ODM / OEM. Airson mion-fhiosrachadh,cliog air Seirbheis Customized (ODM / OEM)
Chaidh DNA a thoirt a-mach à 5 mg de na duilleagan agus sìol arbhair, cruithneachd, rus, soybean agus cotan, fa leth. Chaidh an DNA a mheudachadh le PCR a ’cleachdadh prìomhairean sònraichte. Chaidh 6 μl DNA bho na h-eluents 20 μl iomlan a luchdachadh gach sreath. 1: Genoma smachd adhartach; 2: fàg samples; 3: sampaill sìol; 4: NTC; 5: D2000 primers |
|
M: Comharra TIANGEN D2000; 1: Smachd adhartach; 2-7: Is e an àireamh de spotan fala tiormaichte air a ’phàipear sìoltachain 1-6 fa leth; 8: Smachd àicheil. Chaidh an puncher 3 mm a chleachdadh gus na spotan fala tiormaichte a thoirt bhon phàipear sìoltachain mar an stuth airson an deuchainn às-tharraing. Chaidh 6 μl DNA bho na h-eluents 20 μl iomlan a luchdachadh gach sreath. |
|
M: Comharra TIANGEN D2000; 1: Smachd adhartach (chaidh DNA genomic a chleachdadh mar theamplaid); 2-7: Is e an ìre de fhuil a chaidh a chur ris 10 μl, 20 μl, 30 μl, 40 μl, 50 μl agus 60 μl, fa leth; 8-13: Is e an ìre de fhuil a chaidh a chur ris 10 μl, 20 μl, 30 μl, 40 μl, 50 μl agus 60 μl, fa leth; 14: NTC. Chaidh 6 μl DNA bho na 20 μl eluents gu lèir a luchdachadh air an gel agarose. |
Teamplaid A-1
■ Anns an teamplaid tha neo-chunbhalachd pròtain no luchd-dìon Taq, msaa. ——Purify teamplaid DNA, cuir às do phròtainean pròtain no thoir air falbh teamplaid DNA le innealan glanaidh.
■ Chan eil dì-ghalarachadh an teamplaid coileanta —— Gu h-iomchaidh ag àrdachadh teòthachd dì-ghalarachadh agus a ’leudachadh ùine dì-ghalarachaidh.
■ Milleadh teamplaid —— Ath-ullaich an teamplaid.
Primer A-2
■ Droch càileachd primers —— Dèan ath-synthesachadh an primer.
. Seachain ioma-reothadh agus leaghadh no cryopreserved 4 ° C fad-ùine.
■ Dealbhadh neo-sheasmhach de phrìomhairean (me chan eil fad primer gu leòr, dimer air a chruthachadh eadar primers, msaa.) - Ath-dhealbhadh primers (seachain cruthachadh primer dimer agus structar àrd-sgoile)
A-3 Mg2+dùmhlachd
■ Mg2+ dùmhlachd ro ìosal —— Meudaich Mg gu iomchaidh2+ dùmhlachd: Optimize an Mg2+ dùmhlachd le sreath de ath-bheachdan bho 1 mM gu 3 mM le eadar-ama de 0.5 mM gus an Mg as fheàrr a dhearbhadh2+ dùmhlachd airson gach teamplaid agus primer.
A-4 Teòthachd Annealing
■ Bidh an teòthachd àrd annealing a ’toirt buaidh air ceangal primer agus teamplaid. —— Thoir air falbh an teòthachd blàthachaidh agus dèan an staid as fheàrr le caisead 2 ° C.
Ùine leudachaidh A-5
■ Ùine leudachaidh goirid —— Meudaich an ùine leudachaidh.
Phenomena: Bidh sampaill àicheil cuideachd a ’sealltainn na bannan òrdugh targaid.
Truailleadh A-1 de PCR
■ Tar-thruailleadh sreath targaid no toraidhean leudachaidh —— Gu faiceallach gun a bhith a ’pìobadh an sampall anns a bheil sreath targaid anns an sampall àicheil no gan dòrtadh a-mach às an tiùb centrifuge. Bu chòir na h-ath-bheachdan no an uidheamachd a bhith fèin-ghluasadach gus cuir às do dh ’aigéid niuclasach a th’ ann, agus bu chòir truailleadh a bhith ann tro dheuchainnean smachd àicheil.
■ Truailleadh ath-bheachdan ——Cuir na h-ath-bheachdan agus stòr aig teòthachd ìosal.
A-2 Primer
■ Mg2+ dùmhlachd ro ìosal —— Meudaich Mg gu iomchaidh2+ dùmhlachd: Optimize an Mg2+ dùmhlachd le sreath de ath-bheachdan bho 1 mM gu 3 mM le eadar-ama de 0.5 mM gus an Mg as fheàrr a dhearbhadh2+ dùmhlachd airson gach teamplaid agus primer.
■ Dealbhadh primer neo-iomchaidh, agus tha homology aig an t-sreath targaid leis an t-sreath neo-targaid. —— Ath-dhealbhadh primers.
Phenomena: Tha na bannan leudachaidh PCR neo-chunbhalach leis a ’mheud ris a bheil dùil, an dara cuid mòr no beag, no uaireannan bidh an dà chuid bannan leudachaidh sònraichte agus bannan leudachaidh neo-shònraichte a’ tachairt.
Primer A-1
■ Sònrachas primer bochd
—— Ath-dhealbhadh primer.
■ Tha an dùmhlachd primer ro àrd —— Meudaich teothachd an dì-ghalarachadh agus cuir ris an ùine dì-ghalarachadh.
A-2 Mg2+ dùmhlachd
■ Am Mg2+ tha an dùmhlachd ro àrd —— Lùghdaich gu ceart an dùmhlachd Mg2 +: Optimize an Mg2+ dùmhlachd le sreath de ath-bheachdan bho 1 mM gu 3 mM le eadar-ama de 0.5 mM gus an Mg as fheàrr a dhearbhadh2+ dùmhlachd airson gach teamplaid agus primer.
A-3 Polymerase thermostable
■ Meud cus enzyme —— Thoir air falbh suim enzyme gu h-iomchaidh aig amannan 0.5 U.
A-4 Teòthachd Annealing
■ Tha an teòthachd annealing ro ìosal —— Gu h-iomchaidh àrdaich an teòthachd blàthachaidh no gabh ris an dòigh annealing dà ìre
Cearcaill A-5 PCR
■ Cus de chearcaill PCR —— Lùghdaich an àireamh de chearcaill PCR.
Primer A-1—— Sònrachas sònraichte —— Ath-dhealbhaich an primer, atharraich suidheachadh agus fad a ’phrìomhaire gus a shònrachas a neartachadh; no a ’dèanamh PCR neadaichte.
Teamplaid A-2 DNA
—— Chan eil an teamplaid fìor-ghlan ——Purify an teamplaid no tarraing DNA le pasgain glanaidh.
A-3 Mg2+ dùmhlachd
——Mg2+ dùmhlachd ro àrd —— Lùghdaich Mg gu ceart2+ dùmhlachd: Optimize an Mg2+ dùmhlachd le sreath de ath-bheachdan bho 1 mM gu 3 mM le eadar-ama de 0.5 mM gus an Mg as fheàrr a dhearbhadh2+ dùmhlachd airson gach teamplaid agus primer.
A-4 dNTP
——Tha dùmhlachd dNTPs ro àrd —— Thoir air falbh dùmhlachd dNTP gu h-iomchaidh
A-5 Teòthachd Annealing
——Tha teòthachd blàthachaidh ìosal —— Gu h-iomchaidh àrdaich an teòthachd blàthachaidh
Cearcaill A-6
——To iomadh cearcall —— Dèan lùghdachadh air an àireamh rothaireachd
Is e a ’chiad cheum am polymerase iomchaidh a thaghadh. Chan urrainnear Taq polymerase cunbhalach a dhearbhadh air sgàth dìth gnìomhachd ro-sgaoileadh 3’-5 ’, agus bidh mì-chothromachadh a’ lughdachadh èifeachdas leudachaidh criomagan gu mòr. Mar sin, chan urrainn dha Taq polymerase cunbhalach leudachadh a dhèanamh air mìrean targaid nas motha na 5 kb. Bu chòir Taq polymerase le atharrachadh sònraichte no polymerase fidelity àrd eile a thaghadh gus èifeachdas leudachaidh a leasachadh agus coinneachadh ri feumalachdan leudachadh criomag fada. A bharrachd air an sin, tha leudachadh air criomagan fada cuideachd ag iarraidh atharrachadh co-fhreagarrach air dealbhadh primer, ùine denaturation, ùine leudachaidh, pH bufair, msaa. Mar as trice, faodaidh primers le 18-24 bp toradh nas fheàrr a thoirt seachad. Gus casg a chuir air milleadh teamplaid, bu chòir an ùine dì-ghalarachaidh aig 94 ° C a lùghdachadh gu 30 diog no nas lugha gach cearcall, agus bu chòir an ùine airson teòthachd àrdachadh gu 94 ° C mus tèid an leudachadh a dhèanamh nas lugha na 1 min. A bharrachd air an sin, le bhith a ’suidheachadh teothachd an leudachaidh aig timcheall air 68 ° C agus a’ dealbhadh na h-ùine leudachaidh a rèir ìre 1 kb / min faodaidh sin dèanamh cinnteach gu bheil leudachadh èifeachdach air criomagan fada.
Faodar an ìre mearachd de leudachadh PCR a lùghdachadh le bhith a ’cleachdadh diofar polymerases DNA le fìor dhìlseachd. Am measg a h-uile polymeras DNA Taq a chaidh a lorg gu ruige seo, tha an ìre mearachd as ìsle agus an dìlseachd as àirde aig Pfu enzyme (faic an clàr ceangailte). A bharrachd air taghadh enzyman, faodaidh luchd-rannsachaidh ìre mùthaidh PCR a lughdachadh tuilleadh le bhith a ’dèanamh an fheum as fheàrr de shuidheachaidhean ath-bhualadh, a’ gabhail a-steach dèanamh suas bufair, dùmhlachd de polymerase thermostable agus a ’dèanamh an fheum as fheàrr de chearcall PCR.
Bho chaidh a stèidheachadh, tha an fhactaraidh againn air a bhith a ’leasachadh toraidhean den chiad ìre le bhith a’ cumail ris a ’phrionnsapal
de chàileachd an toiseach. Tha na toraidhean againn air cliù air leth fhaighinn anns a ’ghnìomhachas agus luachmhor am measg luchd-ceannach ùr is sean.